科技部专家组认为，课题的实施已经取得较为显著的成效。一是建立了规模化、工厂化的高效棉花转基因技术体系。采用农杆菌介导法转基因的周期由原来12个月缩短到5-7个月，基因转化率达到7.5%%，嫁接成活率达90%%以上，已将抗虫、抗病、纤维品质改良等基因转入到了20多个主栽棉花品种中；二是培育了一批转基因棉花新品种。培育并通过国家或省级审定的转基因棉花新品种（组合）7个，其产量水平、纤维品质、抗病性、抗虫性等指标达到了国家要求；三是形成了转基因棉花示范推广网络。建成了国家转基因棉花检测与监测中心，建立了7个转基因棉花生态试验站及150个新品种示范网点。已累计推广转基因抗虫棉2548万亩，其中2004年推广1500多万亩，占当年我国转基因棉花种植面积的30%%。
通过课题的实施，河南省已经初步形成了国家级的棉花基因生物技术育种、新品种中试、配套技术和保障及新品种产业化5大技术平台，进一步巩固了河南省在转基因棉花育种领域的技术优势。
